Έντονη είναι η αντίδραση της Εκκλησίας της Κρήτης για την μετατροπής της Μονής της Χώρας στην Τουρκία σε τέμενος, και καλεί την παγκόσμια κοινότητα να δημιουργήσει το θεσμικό πλαίσιο που θα διαφυλάττει την ιστορία των μνημείων του παγκόσμιου πολιτισμού.
Συγκεκριμένα η Ιερά Σύνοδος της Κρητικής Εκκλησίας αναφέρει:
«Ἡ Ἱερά Ἐπαρχιακή Σύνοδος τῆς Ἐκκλησίας τῆς Κρήτης μέ ἀγανάκτηση, συντριβή καί βαθύτατο ψυχικό πόνο, ζεῖ τή νέα προσβολή πρός τήν Ὀρθόδοξη Ἐκκλησία, πρός τόν Χριστιανικό Κόσμο καί τό παγκόσμιο Πολιτιστικό εἶναι καί γίγνεσθαι. Ἡ Μονή τῆς Χώρας σήμερα, στή συνέχεια τῆς Ἁγίας Σοφίας, μετατρέπεται σέ Ἰσλαμικό τέμενος.
Τά Μνημεῖα τῆς Παγκόσμιας Πολιτιστικῆς Κληρονομιᾶς δημιουργήθηκαν ἀπό Πνευματικούς καί Πολιτιστικούς κτήτορες καί τά περίφημα ψηφιδωτά στή Μονή τῆς Χώρας, ὅπως καί στήν Ἁγία Σοφία, ἔχουν Ἑλληνικές ἐπιγραφές.
Ἡ πρόκληση αὐτή γίνεται στίς δύσκολες ἡμέρες τῆς παγκόσμιας πανδημίας, πού προσκαλεῖ τούς Λαούς, τίς Θρησκεῖες καί τούς Πολιτισμούς σέ συνεργασία, ἀλληλοσεβασμό, συνύπαρξη καί συμπόρευση καί ὄχι σέ συνειδητές, μεθοδευμένες καί καταδικαστέες ἀποφάσεις, πού προσβάλλουν τίς θρησκευτικές συνειδήσεις, τίς Πολιτιστικές Ταυτότητες, τόν διάλογο καί τόν ἀλληλοσεβασμό.
Ἡ Ἐκκλησία τῆς Κρήτης στρέφεται μέ προσήλωση στή Μητέρα Ἐκκλησία, τόν Πάνσεπτο Οἰκουμενικό Θρόνο καί τόν Παναγιώτατο Οἰκουμενικό Πατριάρχη μας Κύριο Κύριο ΒΑΡΘΟΛΟΜΑΙΟ, ἐκφράζοντας τή συμπαράσταση καί τήν ἐγκάρδια προσευχητική ἐνίσχυση τῆς Ἱεραρχίας, τοῦ Ἱεροῦ Κλήρου, τῶν Μοναστικῶν Ἀδελφοτήτων καί τοῦ φιλογενοῦς Κρητικοῦ Λαοῦ, μέ ἐλπίδα στή φιλανθρωπία καί τό ἔλεος τοῦ Πανάγαθου Θεοῦ.
Ἡ Ἐκκλησία τῆς Κρήτης καλεῖ τήν Παγκόσμια Κοινότητα νά δημιουργήσει τό θεσμικό πλαίσιο πού θά διαφυλάττει, θά προστατεύει καί θά σέβεται τήν Ταυτότητα καί τήν Ἱστορία τῶν Μνημείων τοῦ Παγκόσμιου Πολιτισμοῦ, στά ὁποῖα συμπεριλαμβάνεται ἡ Μονή τῆς Χώρας (6ος αἰ.), ἀλλά καί ἡ Ἁγία Σοφία».